张仲景著书，自定名曰《伤寒卒病论》。卒者，终也，尽也——谓以伤寒一道，终结诸病。后世不解“卒”字之妙，误为“杂”，遂生“伤寒部分+杂病部分”之妄解，千八百年争论，由此而起。
仲景被尊为医圣，非因写了一部治伤寒的书，而因他掌握了终结疾病之道。道在术中，术中有道，方书之祖，其神在此。
《阴阳大论》以四时物候为始，推阴阳消长，立三阴三阳之框架：太阳、阳明、少阳、太阴、少阴、厥阴。此框架可统摄疾病表里、寒热、虚实之传变，本为宇宙模型，后被引入医学，成为辨证之纲。
今本《伤寒论》卷首《伤寒例》，即《阴阳大论》之佚文。其内容涵盖四时正气、伏气发病、时行疫气、阴阳消长、六经受病，乃全书理论之根。
仲景撰用此书，非为炫耀理论，而是以阴阳为器，以伤寒为用，演示如何以道御病。
张仲景勤求古训，博采众方，据《素问》脏腑经络、《九卷》经脉刺法、《胎胪药录》药学知识，结合自身临床，写下大量条文。
前半部：展示伤寒
以“伤寒”开头之条文，按时间顺序排列：伤寒一日、二三日、四五日、五六日、六七日……直至瘥后劳复。此乃外感病程实录，真实、具体、可征。仲景告诉后人：我就是这样治伤寒的，一个病从头到尾，每一步怎么走，每一证怎么治，都记在这里。
后半部：演示阴阳
以“太阳病”“阳明病”等开头之条文，按阴阳消长之理排序：太阳（阳之表）、少阳（阳之枢）、阳明（阳之里）、太阴（阴之表）、厥阴（阴之枢）、少阴（阴之里）。仲景在此演示：我用阴阳这个框架，把伤寒经验重新整理了一遍。同一个证，可以从时间角度看，也可以从状态角度看；伤寒是这样治，其他病也可以这样治。
两类条文症状重复，非为冗余，乃同一经验之两个版本：前半部是病，后半部是道。病以载道，道以御病。此即“伤寒卒病论”五字真义：以伤寒为入口，终结诸病；以阴阳为根本，演示治法。
西晋太医令王叔和，得仲景遗简，整理编次：
王叔和未改原书之名，然因其整理者仅见伤寒部分，故将所编之书定名为《伤寒论》。原书《伤寒卒病论》之名，仍存于唐代书目。
王叔和之功，在使仲景书得以流传；王叔和之过，在以形取神——他看到了阴阳框架，却未悟仲景以伤寒演示阴阳之妙；他加了脉象，反使后人拘泥脉形，忘了仲景“但见一证便是”之旨。
后世将仲景书总结为“六经辨证”，以为是治伤寒专书，此大谬也。
六经者，阴阳之六态也，非六条经络，非六种病名。太阳者，表之态也；阳明者，里实之态也；少阳者，枢机之态也；太阴者，虚寒之态也；少阴者，虚衰之态也；厥阴者，错杂之态也。无论何病，但现此态，即用此法。
后世将六经窄化为“伤寒六经”，遂以为《伤寒论》只能治伤寒。于是另立温病学派，另立杂病辨证，把仲景一以贯之之道，拆得七零八落。此非仲景之失，乃读者之失也。
任何高大上理论，都要回归到解决实际问题。仲景高明，正在于此：他用阴阳这个道理，去解决伤寒这个实际。他不是空谈阴阳，而是演示阴阳怎么用。后人学了他的阴阳，却只记得伤寒，岂不是书没读通？
北宋林亿等校定医书，见《新唐书·艺文志》著录有《伤寒卒病论》，而传世者唯王叔和所编《伤寒论》十卷，遂以为“卒”乃“杂”之传抄讹误，仲景原书当为《伤寒杂病论》，应有伤寒、杂病两部分。林亿于《金匮要略方论序》中明言：
“张仲景为《伤寒杂病论》合十六卷，今世但传《伤寒论》十卷，杂病未见其书。”
此八字一出，遂成千年定论——人皆以为仲景书有缺失，杂病部分早已亡佚。
后林亿等见蠹简中有三卷本，上卷皆“伤寒”开头，中下卷为杂病方，乃大喜，以为此即失传之“杂病部分”，遂删上卷，按《伤寒论》体例重编中下卷，命名《金匮要略》。
此“按图索骥”之举，实由一字之误解而起。仲景原书本自完整，“卒”非“杂”也。前半伤寒、后半阴阳，本是一书，何来缺失？
《伤寒论》成书之后，另有一脉源流之论，曰“汤液”。
晋·皇甫谧《针灸甲乙经序》首倡“伊尹以亚圣之才，撰用《神农本草》以为《汤液》，汉·张仲景论广《汤液》为十数卷”。北宋林亿《伤寒论序》沿袭此说，元·王好古著《汤液本草》推衍之，民国杨绍伊更以考据之法“逆推”《伊尹汤液经》，试图从《伤寒论》条文中区分何者为“汤液原文”，何者为“仲景论广”。
按仲景自序所举书目，无《汤液经》；原序列举先贤，无伊尹；《伤寒论》全书，无一条“汤液经曰”；王叔和撰次，亦无增入。所谓“汤液一脉”，其文献根基不过皇甫谧一语、陶弘景一书，皆魏晋以后人所言，非仲景自道。以无本之木强为仲景之学寻一祖宗，此后世托古之建构也。
以时间序观“伤寒开头”条文，得仲景之临床；以阴阳排序观“阴阳开头”条文，得仲景之道。两表对勘，可见仲景从伤寒入道之迹，亦可见阴阳六态统摄万病之用。
窦材以阴阳直读，见王叔和所加脉象反成桎梏，故主张扶阳为要，诊脉但分阴阳，不拘二十四脉。其“脉大而昏睡，定非实热”之案，正是以阴阳统脉、不为条框所缚之实践。虽偏于扶阳，然其直读之法，实得阴阳之要。
庞安时著《伤寒总病论》，尊叔和而阐发之，代表宋人主流。窦材则代表异端——跳出框架，直读阴阳。二家并观，可见读法之异。
神者何？阴阳而已。形者何？六经而已，方证而已，脉象而已，汤液而已。
得其神者，可以执大象，天下往。